Säätiön toimintaa johtaa hallitus, joka koostuu perustajayhteisöjen edustajista. Hallituksen puheenjohtajana toimii arkkitehti Antero Polso ja varapuheenjohtajana TM Riikka Reina. Säätiön asiamiehenä toimii dosentti Jaakko Rusama.
Säätiö on perustettu 15.8.1978 ja sen perustajayhteisöt ovat:
Förbundet för Svenskt Församlingsarbete (nykyinen Församlingsförbundet)
Kirkkohallitus
Kristillinen kulttuuriliitto (nykyinen Uskonto-ja kulttuurifoorumi FOKUS)
Kristillinen Taideseura
Suomen Ev. lut. Seurakuntien Lapsityön Keskus
Suomen Luterilainen Evankeliumiyhdistys
Suomen Kirkon Seurakuntaopiston Säätiö
Suomen Setlementtiliitto
Perustajajäseniin kuulunut Suomen Kirkon Seurakuntatoiminnan Keskusliitto (myöhemmin Kirkkopalvelut) on yhdistynyt Suomen Kirkon Seurakuntaopiston Säätiöön